Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCAMP43121 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCAMP43121 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCAMP43121 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCAMP43121 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCAMP43121 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCAMP43121 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCAMP43121 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCAMP43121 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCAMP43121 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCAMP43121 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCAMP43121 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCAMP43121 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCAMP43121 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCAMP43121 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCAMP43121 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCAMP43121 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MCAMP43121 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MCAMP43121 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCAMP43121 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCAMP43121 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCAMP43121 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCAMP43121 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCAMP43121 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCAMP43121 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCAMP43121 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCAMP43121 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MCAMP43121 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCAMP43121 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCAMP43121 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MCAMP43121 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCAMP43121 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCAMP43121 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCAMP43121 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCAMP43121 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCAMP43121 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MCAMP43121 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCAMP43121 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCAMP43121 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCAMP43121 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MCAMP43121 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MCAMP43121 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MCAMP43121 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MCAMP43121 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MCAMP43121 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MCAMP43121 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MCAMP43121 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MCAMP43121 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MCAMP43121 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCAMP43121 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCAMP43121 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCAMP43121 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MCAMP43121 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCAMP43121 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCAMP43121 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCAMP43121 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCAMP43121 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCAMP43121 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MCAMP43121 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCAMP43121 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MCAMP43121 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MCAMP43121 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCAMP43121 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCAMP43121 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCAMP43121 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCAMP43121 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCAMP43121 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCAMP43121 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MCAMP43121 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MCAMP43121 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCAMP43121 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCAMP43121 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCAMP43121 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCAMP43121 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCAMP43121 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCAMP43121 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCAMP43121 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCAMP43121 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCAMP43121 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCAMP43121 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCAMP43121 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCAMP43121 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCAMP43121 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCAMP43121 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCAMP43121 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCAMP43121 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCAMP43121 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCAMP43121 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCAMP43121 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCAMP43121 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCAMP43121 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCAMP43121 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MCAMP43121 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCAMP43121 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCAMP43121 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MCAMP43121 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCAMP43121 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCAMP43121 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCAMP43121 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCAMP43121 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms