Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGCXP38435 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGCXP38435 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms