Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 SKP2-209ENST00000620197 3255 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms