Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD1P28340 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD1P28340 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD1P28340 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD1P28340 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD1P28340 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD1P28340 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD1P28340 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD1P28340 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD1P28340 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD1P28340 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD1P28340 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD1P28340 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD1P28340 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD1P28340 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD1P28340 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD1P28340 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD1P28340 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD1P28340 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD1P28340 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD1P28340 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD1P28340 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD1P28340 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD1P28340 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD1P28340 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD1P28340 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD1P28340 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD1P28340 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD1P28340 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD1P28340 NAT9-219ENST00000582524 573 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD1P28340 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD1P28340 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD1P28340 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD1P28340 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD1P28340 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD1P28340 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD1P28340 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD1P28340 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD1P28340 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD1P28340 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD1P28340 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD1P28340 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD1P28340 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD1P28340 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD1P28340 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD1P28340 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD1P28340 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD1P28340 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD1P28340 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD1P28340 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD1P28340 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD1P28340 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD1P28340 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD1P28340 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD1P28340 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD1P28340 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD1P28340 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD1P28340 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD1P28340 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD1P28340 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD1P28340 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD1P28340 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD1P28340 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD1P28340 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD1P28340 TPST2P1-201ENST00000564073 1102 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD1P28340 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD1P28340 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD1P28340 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD1P28340 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD1P28340 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD1P28340 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD1P28340 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD1P28340 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD1P28340 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD1P28340 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD1P28340 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD1P28340 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD1P28340 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD1P28340 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD1P28340 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms