Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYT1P21579 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYT1P21579 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYT1P21579 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYT1P21579 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYT1P21579 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYT1P21579 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYT1P21579 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYT1P21579 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYT1P21579 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYT1P21579 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYT1P21579 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYT1P21579 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SYT1P21579 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SYT1P21579 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYT1P21579 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYT1P21579 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYT1P21579 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SYT1P21579 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYT1P21579 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYT1P21579 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYT1P21579 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYT1P21579 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYT1P21579 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYT1P21579 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYT1P21579 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYT1P21579 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYT1P21579 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYT1P21579 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYT1P21579 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SYT1P21579 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYT1P21579 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYT1P21579 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYT1P21579 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYT1P21579 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SYT1P21579 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SYT1P21579 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYT1P21579 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYT1P21579 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYT1P21579 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYT1P21579 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYT1P21579 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYT1P21579 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYT1P21579 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYT1P21579 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYT1P21579 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYT1P21579 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYT1P21579 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYT1P21579 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYT1P21579 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYT1P21579 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYT1P21579 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYT1P21579 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYT1P21579 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYT1P21579 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYT1P21579 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYT1P21579 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYT1P21579 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYT1P21579 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYT1P21579 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYT1P21579 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYT1P21579 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYT1P21579 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYT1P21579 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SYT1P21579 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SYT1P21579 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYT1P21579 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYT1P21579 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYT1P21579 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYT1P21579 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYT1P21579 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYT1P21579 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYT1P21579 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYT1P21579 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYT1P21579 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SYT1P21579 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYT1P21579 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYT1P21579 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SYT1P21579 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SYT1P21579 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYT1P21579 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYT1P21579 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYT1P21579 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYT1P21579 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYT1P21579 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYT1P21579 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYT1P21579 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYT1P21579 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYT1P21579 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYT1P21579 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYT1P21579 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYT1P21579 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SYT1P21579 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYT1P21579 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYT1P21579 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYT1P21579 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYT1P21579 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYT1P21579 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYT1P21579 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYT1P21579 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms