Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLDN9O95484 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLDN9O95484 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLDN9O95484 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLDN9O95484 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLDN9O95484 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLDN9O95484 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLDN9O95484 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLDN9O95484 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CLDN9O95484 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CLDN9O95484 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CLDN9O95484 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLDN9O95484 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CLDN9O95484 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLDN9O95484 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CLDN9O95484 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CLDN9O95484 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CLDN9O95484 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CLDN9O95484 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLDN9O95484 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLDN9O95484 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CLDN9O95484 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN9O95484 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN9O95484 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN9O95484 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN9O95484 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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CLDN9O95484 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN9O95484 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN9O95484 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN9O95484 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN9O95484 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN9O95484 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN9O95484 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN9O95484 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN9O95484 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN9O95484 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN9O95484 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN9O95484 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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