Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X4

NR2E3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2E3Q9Y5X4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NR2E3Q9Y5X4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NR2E3Q9Y5X4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR2E3Q9Y5X4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR2E3Q9Y5X4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR2E3Q9Y5X4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR2E3Q9Y5X4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NR2E3Q9Y5X4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR2E3Q9Y5X4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NR2E3Q9Y5X4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR2E3Q9Y5X4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR2E3Q9Y5X4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NR2E3Q9Y5X4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NR2E3Q9Y5X4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NR2E3Q9Y5X4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NR2E3Q9Y5X4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NR2E3Q9Y5X4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR2E3Q9Y5X4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR2E3Q9Y5X4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR2E3Q9Y5X4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NR2E3Q9Y5X4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR2E3Q9Y5X4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR2E3Q9Y5X4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR2E3Q9Y5X4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR2E3Q9Y5X4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR2E3Q9Y5X4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR2E3Q9Y5X4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR2E3Q9Y5X4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NR2E3Q9Y5X4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR2E3Q9Y5X4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR2E3Q9Y5X4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR2E3Q9Y5X4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR2E3Q9Y5X4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NR2E3Q9Y5X4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR2E3Q9Y5X4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR2E3Q9Y5X4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR2E3Q9Y5X4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR2E3Q9Y5X4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR2E3Q9Y5X4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR2E3Q9Y5X4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR2E3Q9Y5X4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NR2E3Q9Y5X4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NR2E3Q9Y5X4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NR2E3Q9Y5X4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NR2E3Q9Y5X4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR2E3Q9Y5X4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR2E3Q9Y5X4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms