Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W9

SNX11, Sorting nexin-11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11Q9Y5W9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX11Q9Y5W9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX11Q9Y5W9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms