Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q8

GTF3C5, General transcription factor 3C polypeptide 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C5Q9Y5Q8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C5Q9Y5Q8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C5Q9Y5Q8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C5Q9Y5Q8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C5Q9Y5Q8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C5Q9Y5Q8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C5Q9Y5Q8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C5Q9Y5Q8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C5Q9Y5Q8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C5Q9Y5Q8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C5Q9Y5Q8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C5Q9Y5Q8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C5Q9Y5Q8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C5Q9Y5Q8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C5Q9Y5Q8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C5Q9Y5Q8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C5Q9Y5Q8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GTF3C5Q9Y5Q8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C5Q9Y5Q8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C5Q9Y5Q8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C5Q9Y5Q8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C5Q9Y5Q8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C5Q9Y5Q8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C5Q9Y5Q8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C5Q9Y5Q8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF3C5Q9Y5Q8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF3C5Q9Y5Q8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF3C5Q9Y5Q8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms