Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms