Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

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Length 1,643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NRXN3Q9Y4C0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NRXN3Q9Y4C0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
NRXN3Q9Y4C0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NRXN3Q9Y4C0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NRXN3Q9Y4C0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NRXN3Q9Y4C0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NRXN3Q9Y4C0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NRXN3Q9Y4C0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NRXN3Q9Y4C0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NRXN3Q9Y4C0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NRXN3Q9Y4C0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NRXN3Q9Y4C0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NRXN3Q9Y4C0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NRXN3Q9Y4C0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NRXN3Q9Y4C0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NRXN3Q9Y4C0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NRXN3Q9Y4C0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NRXN3Q9Y4C0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NRXN3Q9Y4C0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NRXN3Q9Y4C0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NRXN3Q9Y4C0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NRXN3Q9Y4C0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NRXN3Q9Y4C0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NRXN3Q9Y4C0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
NRXN3Q9Y4C0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NRXN3Q9Y4C0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NRXN3Q9Y4C0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
NRXN3Q9Y4C0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NRXN3Q9Y4C0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NRXN3Q9Y4C0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NRXN3Q9Y4C0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NRXN3Q9Y4C0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NRXN3Q9Y4C0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
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