Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFE2L3Q9Y4A8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFE2L3Q9Y4A8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms