Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CAB39Q9Y376 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms