Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms