Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SSX2IPQ9Y2D8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSX2IPQ9Y2D8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms