Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms