Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y228

TRAF3IP3, TRAF3-interacting JNK-activating modulator, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP3Q9Y228 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF3IP3Q9Y228 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms