Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQR0

SCML2, Sex comb on midleg-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML2Q9UQR0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCML2Q9UQR0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 778 ms