Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SHANK2Q9UPX8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SHANK2Q9UPX8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SHANK2Q9UPX8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SHANK2Q9UPX8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SHANK2Q9UPX8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SHANK2Q9UPX8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
SHANK2Q9UPX8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
SHANK2Q9UPX8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
SHANK2Q9UPX8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SHANK2Q9UPX8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
SHANK2Q9UPX8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SHANK2Q9UPX8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SHANK2Q9UPX8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SHANK2Q9UPX8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SHANK2Q9UPX8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SHANK2Q9UPX8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SHANK2Q9UPX8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SHANK2Q9UPX8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SHANK2Q9UPX8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SHANK2Q9UPX8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SHANK2Q9UPX8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SHANK2Q9UPX8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SHANK2Q9UPX8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
SHANK2Q9UPX8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SHANK2Q9UPX8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SHANK2Q9UPX8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SHANK2Q9UPX8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SHANK2Q9UPX8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SHANK2Q9UPX8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SHANK2Q9UPX8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
SHANK2Q9UPX8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
SHANK2Q9UPX8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
SHANK2Q9UPX8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SHANK2Q9UPX8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SHANK2Q9UPX8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SHANK2Q9UPX8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SHANK2Q9UPX8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SHANK2Q9UPX8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
SHANK2Q9UPX8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
SHANK2Q9UPX8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SHANK2Q9UPX8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SHANK2Q9UPX8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SHANK2Q9UPX8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SHANK2Q9UPX8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
SHANK2Q9UPX8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SHANK2Q9UPX8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SHANK2Q9UPX8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SHANK2Q9UPX8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SHANK2Q9UPX8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SHANK2Q9UPX8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SHANK2Q9UPX8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SHANK2Q9UPX8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SHANK2Q9UPX8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SHANK2Q9UPX8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SHANK2Q9UPX8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SHANK2Q9UPX8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SHANK2Q9UPX8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SHANK2Q9UPX8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SHANK2Q9UPX8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SHANK2Q9UPX8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SHANK2Q9UPX8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SHANK2Q9UPX8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SHANK2Q9UPX8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SHANK2Q9UPX8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
SHANK2Q9UPX8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SHANK2Q9UPX8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SHANK2Q9UPX8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SHANK2Q9UPX8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SHANK2Q9UPX8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
SHANK2Q9UPX8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SHANK2Q9UPX8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SHANK2Q9UPX8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SHANK2Q9UPX8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SHANK2Q9UPX8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
SHANK2Q9UPX8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
SHANK2Q9UPX8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
SHANK2Q9UPX8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
SHANK2Q9UPX8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SHANK2Q9UPX8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
SHANK2Q9UPX8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SHANK2Q9UPX8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SHANK2Q9UPX8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SHANK2Q9UPX8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SHANK2Q9UPX8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
SHANK2Q9UPX8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
SHANK2Q9UPX8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SHANK2Q9UPX8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SHANK2Q9UPX8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SHANK2Q9UPX8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SHANK2Q9UPX8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SHANK2Q9UPX8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SHANK2Q9UPX8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SHANK2Q9UPX8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SHANK2Q9UPX8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SHANK2Q9UPX8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SHANK2Q9UPX8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SHANK2Q9UPX8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SHANK2Q9UPX8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SHANK2Q9UPX8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms