Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX3

MYH13, Myosin-13, humanhuman

Predictions only

Length 1,938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH13Q9UKX3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms