Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MRTO4Q9UKD2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MRTO4Q9UKD2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MRTO4Q9UKD2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms