Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA9

PTBP2, Polypyrimidine tract-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP2Q9UKA9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTBP2Q9UKA9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTBP2Q9UKA9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTBP2Q9UKA9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTBP2Q9UKA9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTBP2Q9UKA9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTBP2Q9UKA9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTBP2Q9UKA9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTBP2Q9UKA9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTBP2Q9UKA9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTBP2Q9UKA9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTBP2Q9UKA9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTBP2Q9UKA9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTBP2Q9UKA9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTBP2Q9UKA9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTBP2Q9UKA9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTBP2Q9UKA9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PTBP2Q9UKA9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTBP2Q9UKA9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTBP2Q9UKA9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTBP2Q9UKA9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTBP2Q9UKA9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PTBP2Q9UKA9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTBP2Q9UKA9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTBP2Q9UKA9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTBP2Q9UKA9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTBP2Q9UKA9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTBP2Q9UKA9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTBP2Q9UKA9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTBP2Q9UKA9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTBP2Q9UKA9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTBP2Q9UKA9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms