Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBE1Q9UJT0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms