Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHORDC1Q9UHD1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms