Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH77

KLHL3, Kelch-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL3Q9UH77 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms