Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms