Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIP2Q9UDT6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIP2Q9UDT6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIP2Q9UDT6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIP2Q9UDT6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIP2Q9UDT6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIP2Q9UDT6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIP2Q9UDT6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLIP2Q9UDT6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms