Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms