Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM1

PEMT, Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEMTQ9UBM1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PEMTQ9UBM1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms