Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC7

GALP, Galanin-like peptide, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALPQ9UBC7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GALPQ9UBC7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GALPQ9UBC7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GALPQ9UBC7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
GALPQ9UBC7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
GALPQ9UBC7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GALPQ9UBC7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GALPQ9UBC7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GALPQ9UBC7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GALPQ9UBC7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GALPQ9UBC7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GALPQ9UBC7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GALPQ9UBC7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms