Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP28Q9P2N2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ARHGAP28Q9P2N2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms