Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
RRBP1Q9P2E9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
RRBP1Q9P2E9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
RRBP1Q9P2E9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
RRBP1Q9P2E9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
RRBP1Q9P2E9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
RRBP1Q9P2E9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
RRBP1Q9P2E9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
RRBP1Q9P2E9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
RRBP1Q9P2E9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
RRBP1Q9P2E9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
RRBP1Q9P2E9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
RRBP1Q9P2E9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
RRBP1Q9P2E9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
RRBP1Q9P2E9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
RRBP1Q9P2E9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
RRBP1Q9P2E9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RRBP1Q9P2E9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
RRBP1Q9P2E9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC34.4■■■■□ 3.1
RRBP1Q9P2E9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
RRBP1Q9P2E9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
RRBP1Q9P2E9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
RRBP1Q9P2E9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
RRBP1Q9P2E9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
RRBP1Q9P2E9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
RRBP1Q9P2E9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
RRBP1Q9P2E9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RRBP1Q9P2E9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RRBP1Q9P2E9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
RRBP1Q9P2E9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RRBP1Q9P2E9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
RRBP1Q9P2E9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
RRBP1Q9P2E9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RRBP1Q9P2E9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RRBP1Q9P2E9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RRBP1Q9P2E9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
RRBP1Q9P2E9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
RRBP1Q9P2E9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
RRBP1Q9P2E9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
RRBP1Q9P2E9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
RRBP1Q9P2E9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
RRBP1Q9P2E9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
RRBP1Q9P2E9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
RRBP1Q9P2E9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
RRBP1Q9P2E9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
RRBP1Q9P2E9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
RRBP1Q9P2E9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
RRBP1Q9P2E9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
RRBP1Q9P2E9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
RRBP1Q9P2E9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
RRBP1Q9P2E9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC34.35■■■■□ 3.09
RRBP1Q9P2E9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
RRBP1Q9P2E9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
RRBP1Q9P2E9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
RRBP1Q9P2E9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
RRBP1Q9P2E9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
RRBP1Q9P2E9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
RRBP1Q9P2E9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
RRBP1Q9P2E9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
RRBP1Q9P2E9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
RRBP1Q9P2E9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
RRBP1Q9P2E9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
RRBP1Q9P2E9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
RRBP1Q9P2E9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
RRBP1Q9P2E9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
RRBP1Q9P2E9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
RRBP1Q9P2E9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
RRBP1Q9P2E9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
RRBP1Q9P2E9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
RRBP1Q9P2E9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
RRBP1Q9P2E9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
RRBP1Q9P2E9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
RRBP1Q9P2E9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
RRBP1Q9P2E9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC34.32■■■■□ 3.08
RRBP1Q9P2E9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
RRBP1Q9P2E9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
RRBP1Q9P2E9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
RRBP1Q9P2E9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
RRBP1Q9P2E9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
RRBP1Q9P2E9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
RRBP1Q9P2E9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
RRBP1Q9P2E9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
RRBP1Q9P2E9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
RRBP1Q9P2E9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
RRBP1Q9P2E9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
RRBP1Q9P2E9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
RRBP1Q9P2E9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
RRBP1Q9P2E9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
RRBP1Q9P2E9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
RRBP1Q9P2E9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RRBP1Q9P2E9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
RRBP1Q9P2E9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
RRBP1Q9P2E9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
RRBP1Q9P2E9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
RRBP1Q9P2E9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
RRBP1Q9P2E9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
RRBP1Q9P2E9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
RRBP1Q9P2E9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RRBP1Q9P2E9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
RRBP1Q9P2E9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms