Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B2

PTGFRN, Prostaglandin F2 receptor negative regulator, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRNQ9P2B2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms