Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CXXC1Q9P0U4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CXXC1Q9P0U4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CXXC1Q9P0U4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CXXC1Q9P0U4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CXXC1Q9P0U4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CXXC1Q9P0U4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CXXC1Q9P0U4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CXXC1Q9P0U4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CXXC1Q9P0U4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CXXC1Q9P0U4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CXXC1Q9P0U4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CXXC1Q9P0U4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CXXC1Q9P0U4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CXXC1Q9P0U4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXXC1Q9P0U4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms