Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM1

MYOF, Myoferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOFQ9NZM1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MYOFQ9NZM1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms