Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLR3EQ9NVU0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR3EQ9NVU0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR3EQ9NVU0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR3EQ9NVU0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR3EQ9NVU0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR3EQ9NVU0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR3EQ9NVU0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR3EQ9NVU0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR3EQ9NVU0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR3EQ9NVU0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR3EQ9NVU0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR3EQ9NVU0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR3EQ9NVU0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR3EQ9NVU0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR3EQ9NVU0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR3EQ9NVU0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR3EQ9NVU0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR3EQ9NVU0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR3EQ9NVU0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms