Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SAMSN1Q9NSI8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms