Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC6A13Q9NSD5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms