Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FZD3Q9NPG1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms