Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP85

NPHS2, Podocin, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS2Q9NP85 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPHS2Q9NP85 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms