Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP08

HMX1, Homeobox protein HMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX1Q9NP08 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HMX1Q9NP08 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HMX1Q9NP08 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMX1Q9NP08 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMX1Q9NP08 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMX1Q9NP08 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMX1Q9NP08 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMX1Q9NP08 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMX1Q9NP08 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMX1Q9NP08 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMX1Q9NP08 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMX1Q9NP08 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMX1Q9NP08 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMX1Q9NP08 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMX1Q9NP08 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMX1Q9NP08 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMX1Q9NP08 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMX1Q9NP08 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMX1Q9NP08 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMX1Q9NP08 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMX1Q9NP08 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMX1Q9NP08 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMX1Q9NP08 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMX1Q9NP08 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMX1Q9NP08 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMX1Q9NP08 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMX1Q9NP08 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMX1Q9NP08 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMX1Q9NP08 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMX1Q9NP08 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMX1Q9NP08 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMX1Q9NP08 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HMX1Q9NP08 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMX1Q9NP08 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HMX1Q9NP08 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMX1Q9NP08 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HMX1Q9NP08 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMX1Q9NP08 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMX1Q9NP08 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMX1Q9NP08 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms