Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms