Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBA0

TRPV4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV4Q9HBA0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms