Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q4

NHEJ1, Non-homologous end-joining factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHEJ1Q9H9Q4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NHEJ1Q9H9Q4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms