Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG4Q9H9E3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms