Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7V2

SYNDIG1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, humanhuman

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1Q9H7V2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNDIG1Q9H7V2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNDIG1Q9H7V2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNDIG1Q9H7V2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNDIG1Q9H7V2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNDIG1Q9H7V2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNDIG1Q9H7V2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNDIG1Q9H7V2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNDIG1Q9H7V2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNDIG1Q9H7V2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNDIG1Q9H7V2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNDIG1Q9H7V2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNDIG1Q9H7V2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNDIG1Q9H7V2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNDIG1Q9H7V2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNDIG1Q9H7V2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNDIG1Q9H7V2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNDIG1Q9H7V2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNDIG1Q9H7V2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNDIG1Q9H7V2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNDIG1Q9H7V2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNDIG1Q9H7V2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNDIG1Q9H7V2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNDIG1Q9H7V2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNDIG1Q9H7V2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNDIG1Q9H7V2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNDIG1Q9H7V2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNDIG1Q9H7V2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNDIG1Q9H7V2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNDIG1Q9H7V2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNDIG1Q9H7V2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNDIG1Q9H7V2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNDIG1Q9H7V2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNDIG1Q9H7V2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNDIG1Q9H7V2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNDIG1Q9H7V2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNDIG1Q9H7V2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNDIG1Q9H7V2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNDIG1Q9H7V2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNDIG1Q9H7V2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNDIG1Q9H7V2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNDIG1Q9H7V2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNDIG1Q9H7V2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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