Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E9

C8orf33, UPF0488 protein C8orf33, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf33Q9H7E9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C8orf33Q9H7E9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C8orf33Q9H7E9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms