Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms