Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN2

TGIF2, Homeobox protein TGIF2, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGIF2Q9GZN2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
TGIF2Q9GZN2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TGIF2Q9GZN2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TGIF2Q9GZN2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TGIF2Q9GZN2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TGIF2Q9GZN2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TGIF2Q9GZN2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TGIF2Q9GZN2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TGIF2Q9GZN2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TGIF2Q9GZN2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TGIF2Q9GZN2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TGIF2Q9GZN2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TGIF2Q9GZN2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TGIF2Q9GZN2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TGIF2Q9GZN2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TGIF2Q9GZN2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TGIF2Q9GZN2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TGIF2Q9GZN2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TGIF2Q9GZN2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TGIF2Q9GZN2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TGIF2Q9GZN2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TGIF2Q9GZN2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TGIF2Q9GZN2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TGIF2Q9GZN2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TGIF2Q9GZN2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms