Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ACTR3CQ9C0K3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ACTR3CQ9C0K3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
ACTR3CQ9C0K3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTR3CQ9C0K3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTR3CQ9C0K3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTR3CQ9C0K3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTR3CQ9C0K3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTR3CQ9C0K3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTR3CQ9C0K3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTR3CQ9C0K3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTR3CQ9C0K3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTR3CQ9C0K3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTR3CQ9C0K3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTR3CQ9C0K3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTR3CQ9C0K3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTR3CQ9C0K3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTR3CQ9C0K3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTR3CQ9C0K3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTR3CQ9C0K3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTR3CQ9C0K3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTR3CQ9C0K3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTR3CQ9C0K3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTR3CQ9C0K3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTR3CQ9C0K3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTR3CQ9C0K3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms